事实上，在明治成立之际，对是否要“吞并琉球”仍然存在很大的争议。一方面，由于在历史上，萨摩藩在征服琉球的同时，又默许琉球继续保持中国的“藩属国”的地位。如此一来，它便可以通过琉球的中转，间接地与中国进行贸易，获得了巨额的经济利益。这一点对萨摩藩最后能够领导明治维新，推翻幕府统治起着重要作用。在明治维新以后，萨摩藩仍然舍不得失去这条利益线。另一方面，假若真的将琉球纳入日本的版图之内，那么明治政府不得不从内地派遣警察、教师、公务员等，建立基本的行政体系。这对于刚刚建立政权的明治而言，是一笔巨额的财政负担。因为它还不得不处理国内的士族叛乱（西南战争）、农民起义等等棘手的问题，很难再有余力冒着与中国关系破裂的代价，吞并琉球。
此外，就是对于一直自诩为“皇国”的日本而言，对接受“蛮夷”琉球人存在着人种上的歧视。例如，当外务省提出将琉球国王列入日本“华族”之时，作为立法机关的左院回复曰，“琉球国王乃琉球之人类，不应该与国内的人类相互混淆”，主张继续保持琉球的“属国”地位。换言之，明治高层领导人否认了“琉球人”作为“日本人”的资格。这样的意见，在当时至少得到了大隈重信（1838-1922）、木户孝允（1833-1877）、伊藤博文（1841-1909）的支持。
1903年，在大阪举行的第五回国内劝业博览会中，“琉球人”作为“劣等人种”供展览尽管面对如此大的反对力量，但日本最后还是选择吞并琉球的原因，主要是出于国防的考虑。正如时任陆军大辅的山县有朋（1838-1922）明确指出的一样，琉球虽然土地狭小，但其地位于日本本土、中国大陆及台湾之间，是海上交通要地。如果日本不去吞并琉球，西洋列强恐怕也会占领。事实上，英国对此地也早有觊觎。例如，Frederic H. Balfour（1846-1909）写道，“假若我英国得此（琉球）群岛，在此地布兵设防，驻屯于太平洋之中，一定提高我英国在东洋之地位”。因此，井上毅（1844-1895）才会呼吁，要将琉球改为“皇国之翰屏”。
此外，就是对于一直自诩为“皇国”的日本而言，对接受“蛮夷”琉球人存在着人种上的歧视。例如，当外务省提出将琉球国王列入日本“华族”之时，作为立法机关的左院回复曰，“琉球国王乃琉球之人类，不应该与国内的人类相互混淆”，主张继续保持琉球的“属国”地位。换言之，明治高层领导人否认了“琉球人”作为“日本人”的资格。这样的意见，在当时至少得到了大隈重信（1838-1922）、木户孝允（1833-1877）、伊藤博文（1841-1909）的支持。
1903年，在大阪举行的第五回国内劝业博览会中，“琉球人”作为“劣等人种”供展览尽管面对如此大的反对力量，但日本最后还是选择吞并琉球的原因，主要是出于国防的考虑。正如时任陆军大辅的山县有朋（1838-1922）明确指出的一样，琉球虽然土地狭小，但其地位于日本本土、中国大陆及台湾之间，是海上交通要地。如果日本不去吞并琉球，西洋列强恐怕也会占领。事实上，英国对此地也早有觊觎。例如，Frederic H. Balfour（1846-1909）写道，“假若我英国得此（琉球）群岛，在此地布兵设防，驻屯于太平洋之中，一定提高我英国在东洋之地位”。因此，井上毅（1844-1895）才会呼吁，要将琉球改为“皇国之翰屏”。
