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生信分析数据分析

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生信零基础一对一辅dao,内容主要包括二种:
1.基础生信知识讲解,包含:
1.1TCGA和GEO数据下载和预处理
1.2 数据差异基因筛选
1.3 差异基因的蛋白互作网络构建
1.4 蛋白互作网络种核心节点分析(基于Cytohubba和MCODE算法)
1.5差异基因的GO和KEGG富集分析
1.6疾病组GSEA富集分析
1.7 筛选到核心基因上下游分析机制
此部分为基础生信分析,耗时在2到3小时之间。
2.进阶生信方法
2.1 GSVA(基因集变异分析)
2.2 WGCNA(加权基因共表达网络分析)
2.3 ceRNA(竞争性内源RNA)分析
2.4机器学习算法筛选核心自变量
2.5基因预后模型分析
2.6 miRNA分析
2.7 Cytoscape构建ceRNA网络
2.8单细胞分析(在线数据库,主要为肿瘤)
2.9 基因与疾病临床特征分析(适合肿瘤)
2.10基因效应机制分析
2.11免疫浸润细胞分析并可视化
2.12基因与免疫细胞关联分析
2.13 预后模型评估
2.14铁死亡、自噬、铜死亡和免疫等表型分析
2.15药物敏感性分析
2.16 基因灵敏性分析
2.17基因分子分型
2.18基因特异性组织表达分析
2.19免疫逃逸和免疫检查点
2.20生信热点分析
此过程为进阶版,耗时在8到10个小时左右。
学员可选择基础版和进阶版,根据自身条件进行选择,此外还可以围绕生信热点进行一一讲解,目标是用最短的时间讲最高效的知识,也希望自己的知识得到传播。当然,也希望在传播知识的同时挣一点知识费用。大家时间宝贵,非诚勿扰。有意联系。


IP属地:广东来自iPhone客户端1楼2024-03-27 09:28回复