从登场过的两个杀手来看，他们本人对魔法使没有什么怨恨，甚至最新话的杀手还表示对刺杀的对象要尊重，那么动机就基本不可能是仇恨。
如果是要为战争做准备，那也没必要去刺杀连人影都找不到的芙莉莲，印象里芙莉莲也没有说过自己杀过人，极有可能她本人都不会去干涉人类之间的战争。
我作一个不负责任的猜测，会不会是因为帝国有个什么先知，跟帝国讲“为了帝国繁荣，你们必须除掉这几个名单上的魔法使”，于是帝国就按着名单开始动手