学校读博和研究所读博的区别主要在于研究环境和资源、导师指导方式以及毕业要求。一般来说，学校的博士项目更注重理论研究和创新性探索；而研究所则更加侧重于应用基础和应用技术研究方面。此外，在导师指导和课程设置上也有所不同。