主角光环就不提了，难免。
不管日本人当时实力有强，就如美国即使在一些小国驻扎有军事基地，也不可能随便出动军队袭击该国的政府机关或属下机构。何况日本使馆管辖下日租界有限武装，怎么可能去袭击上海国统区正规军校机构。也不可能随意上列车搜查。毕竟蜂巢里顾盼刺杀日本外交官时候，中日并未宣战，在淞沪战役前，上海都是国民党统治重要地盘，日本使馆的所谓行动队出了日租界若那么妄为，肯定要被驻淞沪部队，警备部队和警察消灭的。这是社会背景常识。
另外青山军校似乎担当了情报局、保安局、警察局的功能，军校主要培养训练人员，最多可以收集情报和介入保安吧。
罗星明怎么知道黄素梅和张华贵约定地点的？这事只有这2个人晓得啊。
军校怎么可能有蜂巢机密镜子计划文件？
薛兴为什么要把情报给素不相识的杨树全而不是直接给中共。
夏恩和顾盼在第10集时怎么晓得蒲丛是蜂巢安插在军校的内线。而蒲丛当时在亚新饭店抓捕对付美国空军联络官的杀手，日本大使行动队袭击军校，蒲丛甚至围捕蜂巢成员甚至金先生。这些证据不仅不能表明蒲丛是蜂巢成员，却更易指证蒲丛在蜂巢的对立面。虽然这也是该剧不合情理剧情点。
金先生叫谭仲文和顾盼私奔不是比刺杀谭仲文更好吗，至少此二人私奔之后对蜂巢组织再无威胁了。
杨行长做为金融系统高官，在国民政府重要部门应有档案原件吧，军校本无资格留存最多因情报需要可能拿到一份杨树全档案的复印件。请问蜂巢大费周章调换军校的一个杨行长的档案备份有什么意义？能动得了杨行长吗，就算杨行长不做行长了。当时国民政府金融政策不可能因之而变的对蜂巢有利。国民党当局另找的行长就能够对蜂巢更有利了吗？蜂巢最后袭击杨树全有什么作用？使人费解。
两利相权取其重，蒲校长既然是蜂巢的人，除非和其个人利益出现重大冲突。否则他不可能公开对抗蜂巢组织。他亲自阻止刺杀美空军谈判官为哪般。而蜂巢派人伴军校的人袭击王盛乡去叫蒲丛背锅为哪般，袭击军校也甚不妥更不可能。若说蒲丛通过黑龙堂万九他的私人武装想劫白银勉强说得过去。但这样重要的运送白银货船，不只是行踪保密，国民党当局肯定要派出护卫船舰护航吧，不可能几股小武装势力就能轻易劫船的吧。蒲丛身为蜂巢的重要骨干甚至派黑泷堂的人围剿蜂巢，这又是为哪般。金先生做为蜂巢的领导，蜂巢卧底名单他有什么不晓得，为什么还需通过顾盼去拿黑匣子。金先生直接打一个电话给蒲丛叫他把黑匣子交上来至少销毁不就得了。就算拿到了又怎么样，蒲丛难道不可以随时制做其它证据。黑匣子的得失交代真乱。记得有一集说已破译了，后面又去到列车上找。即说销毁了，但又破译了。编的乱。蒲丛要留证据随时可以用各种不同的载体记录，但这个对蜂巢来说并不是秘密，只是其自保的一个手段，这类事谁也限制不了。但这类暗中留存的证据应该是只有他个人知晓的，剧里是天下都知。这闹到天下都知晓了他有这么一个制衡蜂巢的黑匣子他居然还不销毁。就等着被国共两党取走破译是吧。做为其上峰的金先生知晓了似乎也无权问他要，他也可以继续保留记录组织机密的黑匣子抗拒不告诉或交给金先生，难以想象。
蜂巢死了很多人没刺杀冯将军。但后来蒲丛绑架了冯将军却只是关押。
黄素梅一直怀疑夏恩，但夏恩和顾盼想通信就电报，想见面就见面换情报，想联络随意传递信息，想帮顾盼营救共产党员罗星明就可随意行动做内应，想怎么通风就怎么报信。蒲丛被捕后跳楼送到医院，夏恩收到审讯被黄素梅救下，按理说夏恩应是被关押或监控的状态，但夏恩似乎不仅被黄素梅救下，而且还得到了可自由联系顾盼、还可出军校到教堂和顾盼面谈，而黄素梅也竟然没派人跟着，这本是可用夏恩做饵抓捕顾盼的。夏恩甚至期间为了找其母亲离开军校三天，既然夏恩这么可以随意出入军校，可叹后面顾盼拿还没破译的有巨大价值的黑匣子去和黄素梅换夏恩，而黑匣子被黄素梅得到后，夏恩却仍在军校。这夏恩是什么特殊角色啊。黄素梅对夏恩几乎是不设防或监控毫无作用的状态。这黄素梅太不给力了吧。
同理，罗星明虽是日本使馆副队长，但在龙智捷暗哨防备情况下，同样单独来去自如去执行那些和中共有关任务，夏恩随时可到军校，顾盼也可。顾盼在军校和调查局2次脱身象玩一样。刺杀了日本外交官居然还能够进日本使馆行动队。罗星明一次在蜂巢，一次在军校2次脱身就更显主角光环了。罗星明为了使顾盼得到黄素梅信任和设法除去黄素梅而自愿被抓无此必要冒险。若其无主角光环就无必要的挂了。另外罗星明共产党身份已暴露，他还能继续进行秘密任务吗？
就算主角光环可暂且不提及。但剧集里不合情理逻辑的非主角光环BUG确实多了点。甚至有的一集里能找到3-6处不合情理的BUG。蜂巢剧情经不起推敲。
而国产经典谍战剧纵观全剧一般就十多处BUG而已。
但角色演技还算不错，宋轶扮相楚楚生怜挺适合演女特工，所以，想起她演伪装者成名剧作。