由于梅杰综合征较为少见，许多非专科医生了解不多，误诊误治的情况比较常见。云南中西医结合医院面神经专家介绍，梅杰综合征诊断应与面肌抽搐、布鲁热综合征、重症肌无力等疾病进行鉴别，另外还有这些下列这些疾病，一起来具体了解下。
　

　迟发性运动障碍，有长期服用吩噻嗪类、丁酰苯类抗精神病药物史，受累肌常以蠕动为主而非肌肉痉挛。
　　

偏侧面肌痉挛，常局限于一侧及面神经支配肌，不伴口、下颌肌张力障碍样不随意运动，偶可累及双侧，但双侧痉挛不同步与梅杰综合征不同。
　

　神经症也易于梅杰综合征误诊，可发生于任何年龄，常伴情绪健康搜索不稳睡眠障碍，症状变化多，波动大，心理治疗有效。
　　

布鲁热综合征与梅杰综合征的区别在于，前者有张大口的症状，在张力障碍发作间隙阵发性呼吸深快，同时伴发眼球震颤，其发病机理定位在桥脑。
　　

梅杰综合征与重症肌无力均有眼睑开合减弱，但后者眼球位置会发生变动，以通过眨眼来纠正肌无力时眼肌的疲劳，同时眨眼时伴随缓慢的扫视。而梅杰综合征由于眼外肌的疲劳导致眨眼这个连带运动，从而导致自发性睑痉挛。