武道医王有两位女主角。一个是中谷也香，是主人公多和一派师傅，受久影公授训创办武道医学，被封为“武道医王”。另一位是石原美穗，是石原家族的家主，也是多和的学生，协助他分析病因，治疗怪病，后来成为武道医王的徒弟，担任“保护神”的职位。这两位女主角都具有聪明、勇敢、坚毅的特质，在每一集中给多和和观众一种正能量的感动。作者X·T·森在剧中著重描写女主角们的内心探索，从而表现了女性的智慧和勇气。在剧中，她们帮助多和解决了一个又一个奇难问题，成功实施了武道医学，成为了武道医王的最佳助手。除了中谷也香和石原美穗这两位女主角，剧中还有一个有趣的角色——丛间月子，她是多和的学生，也是超常的神灵，帮助多和解决谜团，并被称为“另一个女主角”。