蜥蜴一般主要以昆虫，小型鸟类及其它小型动物为食，还有一部分蜥蜴也会吃一些植物。例如水拟龙和几乎所有科的蜥蜴，主要是以昆虫、小型鸟类及其它小型动物为食。而巨蜥一般以啮齿类为食，还会吃小型脊椎动物、鱼、蛇等，冠蜥主要吃昆虫及其它小型动物，也消食一些鳞类、爬行动物及小型脊椎动物。大多数蜥蜴都以活物为食，但也有一些可以吃死物，例如夜行蜥蜴，因其特有的酶把死尸腐败物质作为营养剂，从而获得营养，此外，还有一些蜥蜴能够吃到腐腹的蔬菜、水果等。蜥蜴在吃食方面是相当有特色的，它们不仅可以吃死物，还对有毒的植物类的果实或者嫩枝有一定的耐受性，尤其是当植物的毒素在它们的体内形成一种毒素耐受时，它们便可以放心地去吃这类毒果了。不同种类的蜥蜴也会因生活圈和活动区域而选择不同食物，比如一个住在湖边的蜥蜴，会选择吃鱼、蝎子、蚂蚁等，而一个住在草原上的蜥蜴，则倾向于吃昆虫、蝗虫，或者其它小型动物，比如老鼠、鼩鼱等。