更换发动机后的通病是新发动机在运转前需要进行一定的磨合，否则容易出现发动机失灵、油耗增加、动力减弱等问题。因此，新发动机更换后的前1000公里内，车主应该遵守严格的磨合规定，避免高速行驶、超载、急加速等行为，确保发动机的稳定运行和延长发动机使用寿命。同时，车主还应该定期进行发动机保养和检查，避免因疏忽而导致发动机故障。