公交车司机可以通过以下方式进行投诉：向所在公司的人事部门或客户服务部门进行投诉；拨打公交服务热线进行投诉；在公交车上填写投诉表格或留下联系方式。公交车司机在工作中需要遵守交通规则，保证乘客的安全。如果乘客发现司机存在违规行为或服务不周等问题，可以通过投诉来反映问题，促进公交公司提高服务质量。