常规会将微生物实验室分为准备室、普通实验室、灭菌室、恒温培养室（如细菌培养室、霉菌培养室、液体培养室、固体培养室等）和无菌室这五部分。
1、准备室：用于配备培养基、样品处理和洗刷器皿等。
2、普通实验室：用于微生物的观察、计数和生理生化测定工作。
3、灭菌室：用于培养基和各种器具的灭菌。
4、恒温培养室：目的是通过人工的方法，获得一个相对稳定的温度环境，而这个温度环境对于要研究或者生产的生物是最为适宜的。在布局时需要分内、外两间，内室是培养室，外室是缓冲室，两室的室中央均需安装紫外线灯用以灭菌；安装恒温恒湿机以维持室内温湿度；并在隔墙上方设置带空气过滤装置的通风口。
5、无菌室：目的是保证菌种纯种、防止杂菌的污染。跟恒温培养室一样，需要分内、外两间，内间无菌室，外间缓冲室。内室需要完全密闭并做好日常的清洁卫生，防止室外不净气体或者昆虫进入，与外界还要有完善的物流窗和高效空气过滤除菌设备。专用白大褂或专用衣帽放在外室。内外室采用先进高效层流空气净化系统以保证恒温、恒湿、换气量和空气洁净度的相关要求。
不过关于微生物实验室的规划布局，不同行业的具体方案又会不一样。在上海嘉定区做微生物实验室，我建议你找CEIDI西递，这家公司可以针对不同行业、类型的实验室、洁净无尘车间等洁净工程提供专业可靠的总承包服务，从设计师到施工团队都积累了专业的实践经验，擅长因地制宜为实验室从业人员创造优质、安全、可持续发展的实验环境，在江浙沪区域蛮有名气的。