1580年葡萄牙继承危机中，符合传统合法性性的前五顺位的继承人分别是：1-帕尔马及皮亚琴察公爵拉努乔一世；2-布拉干萨公爵夫人卡特琳娜；3-西班牙国王菲利普二世；4-神圣罗马帝国皇后，奥地利的玛利亚；5-萨伏伊公爵埃曼纽尔。
第一位的拉努乔一世的宣称虽然最强，但是继承危机时年方11岁，而且身处远方的意大利，实力也不够争夺王位，所以其实是很自然的出局了。而第四第五位的已经太过边缘，所以事实上在合法继承链中最有竞争力的就是卡特琳娜和菲利普二世，但是这两人分别有着自己的不足，前者是女人（那时葡萄牙历史上还没有女性当国王的先例），后者是外国人。
在这种情况下，贝雅公爵的私生子安托尼奥便有了竞争的机会，他作为非法的私生子并没有合法的继承权，但是他自身克服了两位合法继承人所具有的缺陷，因此成为了第三位竞争者。安托尼奥于1531年出生于里斯本，在科英布拉接受教育，并且成为了医院骑士团的一员，参加了1578年的三王之战。在这场导致塞巴斯蒂安一世失踪的战争中他被摩尔人俘虏，但是摩尔人认为他是一个贫穷的小贵族，于是他以小小一笔赎金的代价就得以返回葡萄牙。1580年继承危机时，他站出来自称葡萄牙的国王，并且认为私生子成为国王应当是没有问题的（1383年继承危机中登基的阿维什骑士团长若昂一世也是私生子）。在这种情况下，他确实得到了一些葡萄牙本土势力的支持，但是他的军队无法与阿尔巴公爵率领的西班牙军队抗衡，最终被迫带着葡萄牙王冠上的许多珠宝流亡到了法国，他得到了法国王太后凯瑟琳.德.美第奇的欢迎，他答应以一部分的珠宝以及巴西殖民地作为法国帮助他夺回王位的回报，然而法国为他征集的冒险者军队在海上又被西班牙海军打败了。出于对西班牙可能派出的暗杀者的恐惧，他又流亡到了英格兰，成为伊丽莎白一世的宾客，在1589年，也就是无敌舰队被英国人打败后的第二年，他伙同一些英国船只抵达伊比利亚的海岸附近，希望自己的出现能够鼓励葡萄牙人进行对菲利普二世的反抗，然而无疾而终。晚年的他在法王亨利四世的资助下生活在巴黎，并于1595年去世。
现在回到继承危机时期，谈谈布拉干萨公爵夫人卡特琳娜。作为安托尼奥和菲利普二世的表妹，这位女性在整个继承危机期间乃至结束以后都掌握着王位的强宣称。在菲利普二世成为葡萄牙国王之后，他以丰厚的报酬来劝说布拉干萨公爵若昂，希望他能够让自己的夫人放弃这个宣称，但是若昂在卡特琳娜的影响下拒绝了这一要求。奈何菲利普二世王位稳固，卡特琳娜没有得到任何机会。1583年丈夫去世后她就过着寡居的生活，直到1614年去世，没人料想到的是，她的孙子布拉干萨公爵若昂在1640年最终被推举为葡萄牙国王并且领导了对西班牙的独立战争，是为布拉干萨王朝的若昂四世。从这个角度来说，或许卡特琳娜才是最终的胜利者。
关于1580年继承危机中西班牙人遭遇的反抗的问题，其实比较容易解释。相对于1383年继承危机面对卡斯蒂利亚的干涉，在这次危机中接受西班牙人的联合统治其实是利大于弊的。当时葡萄牙的财政处于相当窘迫的状况，海外的殖民事业也遇到瓶颈，在这种情况下，和西班牙联合就可以缓解经济上的危机，让西属殖民地的资源更容易为葡萄牙所用。再加上当时伊比利亚民族联合的思想也有一定的民意基础，多种因素共同作用，使得1580年葡萄牙对西班牙的接受显得十分顺利，没有太大的阻碍。然而葡萄牙人也没有预料到荷兰人后来会对葡萄牙的殖民地产生多大打击，以及三十年战争中会被要求出兵镇压加泰罗尼亚分离主义者的情况，所以说葡萄牙后来的独立很大程度上是后来的事情所影响导致的。
在伊比利亚联合时期，葡萄牙和西班牙是共主邦联，葡属殖民地和西属殖民地依然有着明确的划分，葡萄牙王国也具有相当的自治权，只是两国作为一个政治经济共同体有着高度的联系。至于澳门，我并没有查到关于它具有什么特殊地位的资料，但有一段文字表明，菲利普二世不愿意破坏该殖民地的原有秩序，于是让它继续进行和西属菲律宾的贸易，而且不干涉它的对华贸易。
关于菲利普二世时期西班牙征服中国的计划确实是存在的，新西班牙总督区以及菲律宾殖民地的许多官员都曾经向菲利普二世反复提出这个计划，他们知道中国是极其富饶的，有巨大殖民的和传教的空间，但是他们对中国的实力估计不足，认为有几千名西班牙士兵伙同一些南洋的中国和日本海盗就足以占领一个沿海省份（参见同一时期丰臣秀吉出动16万大军远征朝鲜的结果便可以知道这个计划基本不可能成功）。这个计划并没有被菲利普二世批准，因为西班牙的国库十分紧张，需要支持与英格兰和尼德兰的战争，还要出资干涉法国宗教战争。在得不到马德里批准的情况下，1596年，一些西班牙殖民者带领一些士兵、日本佣兵以及菲律宾本土士兵，合计约三四百人发动了一场对高棉的湄公河三角洲地区的进攻行动，最终得不偿失，宣告失败。
资料来源：
https://en.wikipedia.org/wiki/Portuguese_succession_crisis_of_1580 https://en.wikipedia.org/wiki/Catarina,_Duchess_of_Braganza
https://en.wikipedia.org/wiki/Ant%C3%B3nio,_Prior_of_Crato
https://en.wikipedia.org/wiki/War_of_the_Portuguese_Succession https://en.wikipedia.org/wiki/History_of_Macau http://www.samuelhawley.com/imjinarticle3.html
